本館自民國84年8月1日開館啟用，除辦理一般分館圖書借閱及推廣活動業務外，並於民國94年至103年承辦全館館際合作業務，於民國95年至103年與教育部合作，設有「南區留學資料中心」，及於民國97年與美國在台協會合作，設有「美國資料中心(專區)」，原以「留學資料」為館藏特色，因配合103年11月總館新建落成，南區留學資料中心遷移至新館舍，提供市民多樣化服務。
本館位於三民區民眾活動中心四樓，格局為長方型，樓層面積共計476坪(1,575平方公尺)，計有閱覽席次共236 席次，目前藏書量約14萬餘冊，雜誌訂閱種數共46種、中文報紙15份、英文報紙1份、四方報泰文1份。
樓層配置含普通圖書區（座位數52位）、兒童圖書區（座位數30位）、館藏特色專區（座位數20位）、參考書區、期刊區、資訊檢索區（座位數8位）、閱報區（座位數12位）、藝文研習教室（座位數40位）、自修室（座位數122位）等。
本館位於三民區寶珠里，且後有愛河支流「寶珠溝」環繞，故命名為「寶珠分館」。本館是三民區設置的第二所分館，緊臨高雄應用科技大學、高雄高工、立志中學、樹德高職，正興、鼎金、陽明、民族國中及多所小學，人文薈萃，學風鼎盛。三民區面積為19.79平方公里，共有88里1,750鄰，人口數約3萬5千人，為高雄市人口數第二名，乃屬高雄市首善之區，區內設有許多踏青遊憩、休閒廣場、社區協會、寺廟等機構，包括國立科學工藝博物館、金獅湖風景區、親子公園、三鳯中街、社區協會、玉皇宮、三鳯宮、義民廟等，皆為區內居民人文及生活重心。
本館原館藏特色為「留學」，因配合業務調整，原館際合作業務及留學資料中心自104年1月移回總館，又因三民區文風鼎盛，人口眾多，故自民國104年1月起，改以「教育」為館藏特色，每月舉辦多項活動。
「寶珠溝」目前仍然存在，位於高應大、正興國小，一路延伸至覺民路尾端，還能看見未加蓋的大水溝。「寶珠溝」是愛河水系的中支流，命名的由來，係因清朝時農民為便利灌溉，在現今果菜批發市場後方興建寶珠埤，用來灌溉農作物，農民視圳水為甘霖，有如農耕之寶，於是稱為「寶珠溝」。本館有感於原有動線設計不佳，於99年底向教育部爭取經費進行空間改造，負責設計的三工場建築師事務所江厚富設計師，特地納入「寶珠溝」的意象，將本分館的服務台及期刊區的座位，設計成新月型弧線，塑造寶珠溝渠水流動的在地意象，代表本館是「擷取知識的寶珠」。江厚富設計師更發揮創意，在兒童室的設計中，加入童話的元素，以八爪章魚及傑克魔豆藤蔓意象塑造兒童室的書架，搭配色彩繽紛、如魔術方塊趣味造型的座椅，讓孩子更沈醉於圖書的世界中。
本館是個充滿濃郁人情味的地方，志工們大多是住在附近的社區民眾，有六、七十歲退休的老師，有可愛的學生志工，還有辛勤的上班族，利用工作閒暇之餘來幫忙。他們之中有人是來館內借閱圖書後，感受我們的熱情，而留下來幫忙。來這裡授課的老師們，也大多是有一腔熱血的志願服務性質，讓大家能在生活中增添知識及情趣。
本館圖書使用率很高，所以新書只要一上架，很快就會被借閱，導致民眾常會抱怨看不到新書，期待大家能一起加入募集圖書，成為書香推手的一員。
館藏狀況：本館目前藏書量142,319冊，預計達到館藏199,246冊(增加56,927冊)
